Isu adanya blacklist masuk PTN bagi siswa SMA N I Sleman karena ada siswa yang melakukan tindak kriminal dibantah oleh Humas UGM dan UIN. Hal itu disampaikan Wijayanti Kabid Humas UGM, dan Rahmi, Humas UIN Yogya, Selasa, 23 Juni 2015 saat jumpa pers dan buka bersama di RM Umbul Permai. Wijayanti menyatakanpihak UGM tidak pernah mem-blacklist sekolah dari manapun juga di seluruh Indonesia, sehingga penentuan siswa yang lolos di UGM murni mengikuti aturan dari jalur seleksi yang telah ditetapkan, kalau melalui jalur SNMPTN berdasarkan catatan akademik/nilai raport dari siswa yang bersangkutan, sementara bila melalui jalur SBMPTN maupun UM berdasarkan hasil tes tertulis siswa yang bersangkutan. Jadi dalam seleksi tidak mempertimbangkan apakah sekolah pernah melakukan hal yang negatif. Jika siswa masuk UGM dan kemudian melakukan hal yang melanggar peraturan, barulah dikenakan sanksi sesuai aturan yang ada di UGM. Kalau kebetulan siswa tidak diterima melalui jalur SNMPTN itu kemungkinan karena pilihan program study yang ketat persaingannya.

Hal yang senada juga disampaikan Rahmi Tri Mei Maharani Humas UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta, bahwa pihak UIN juga tidak pernah melakukan blacklist kepada sekolah manapun. Bila hal itu dilakukan berarti UIN Suka  akan merugikan pihak sekolah, sehingga hal itu hanya rumor yang tidak benar. Dia menegaskan yang tidak benar  bila pihak sekolah menganulir nilai raport, bila hal ini dilakukan langsung tidak akan diterima. Penerimaan mahasiswa baru di UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta dilakukan melalui 5 jalur, yakni SNMPTN, SPAM – PTAIAN (Diselenggarakan Kemenag RI), SBMPTN, UM PTAIAN dan jalur mandiri reguler.
Sementara itu Arif Haryono SH. Kepala DIKPORA Sleman mengakui siswa sekolah di Sleman jumlahnya sedikit yang diterima melalui jalur SNMPTN, tidak sebanyak yang melalui program SBMPTN dan UM. Siswa tidak dapat diterima melalui jalur SNMPTN, semata-mata karena idealisme anak maupun orang tua dalam memilih Program Studi tanpa melihat nilai raport yang ada. Namun demikian pihak  sekolah juga telah berusaha membimbing siswa dalam menentukan pilihan. Arif juga menegaskan dengan adanya penjelasan dari pihak PTN ini menyanggah  adanya rumor blacklist tidak benar.***